Genomsekvensering i NICU förbättrar vård, sänker kostnaderna

[ad_1]

     

ORLANDO – För patienter i neonatalintensivvården (NICU) kan misstänkta genetiska störningar diagnostiseras med helgenomkodning på en bråkdel av den tid det tar för att komma fram till en diagnos med standardprovningsmetoder och vid en lägre kostnad, visar ny forskning.

     

Faktum är att besparingar relaterade till vård som eliminerades på grund av sekvensering var väsentligt större än kostnaden för sekvenseringen i sig, säger Shimul Chowdhury, doktor, från Rady Children's Institute for Genomic Medicine i San Diego.

     
     

Sequencing förebyggde också potentiell skada för minst en patient, han rapporterade här på årsmöte för American Society of Human Genetics 2017.

     

NICU-inställningen är idealisk för att demonstrera både den kliniska användbarheten och kostnadseffektiviteten hos snabb-genom-genomsekvensering på plats, Dr Chowdhury berättade Medscape Medical News .

     

       Vi visar att det finns cirka 50 000 barn i USA som behöver denna testning men inte får det just nu.
     

     
     
     

"Intensive Care Unit-befolkningen är enligt mig en bra sötplats, för att du har dessa scenarier där genetiska diagnoser verkligen kan påverka förvaltningen, och det är en mycket underordnad befolkning", sa han. "Vi projicerar att det finns cirka 50 000 barn i USA som behöver denna testning men inte får det just nu."

     

För sin studie, följde Chowdhury och hans kollegor spädbarn som presenterade tecken och symtom som indikerar en gen-störning eller som hade en klinisk kurs som inte följde ett typiskt mönster. Ingen av patienterna hade en känd genetisk diagnos vid baslinjen.

     

För de första 42 spädbarnen som genomgick genom genomgående sekvensbestämning, diagnostiserades en genetisk störning hos 18 (43%), ändrades hanteringen hos 13 (31%) och resultaten förändrades i 11 (26%).

     
     

Tolv av spädbarnen hade flera medfödda abnormiteter. Andra hade neurologiska, lever-, hjärt-, hematologiska, gastrointestinala, endokrina, muskuloskeletala eller pulmonella abnormiteter eller symptom.

     
     

En spädbarn som upplever infantila spasmer visade sig ha epilepsi relaterad till genen GABRA1 som är involverad i utvecklingen av neurotransmittorns gamma-aminosmörsyra, så att en förändring av antiepileptiska medel genomfördes.

     

En spädbarn med förtida pulmonell atresi, dålig viktökning, utfodringsintolerans och återkommande lunginflammation visade sig ha en mutation i genen ACTG2 som kodar för gamma-2 aktin, ett protein som är involverat i intestinal smidig muskelkontraktion. Efter att barnet startades på cisaprid, förbättrades ett gastrisk motilitetsmedel, rörmotilityen och barnet blev sparat från att genomgå en tarmtransplantation.

     

Kostnadsmodellering

     

För att uppskatta kostnadsbesparingar såg Dr Chowdhury's team data på sex av spädbarnen vars ledning och resultat förändrades efter diagnosen av en genetisk störning.

     
     

De jämförde den faktiska användningen av hälsotillgångar av fem av spädbarnen med användning av historiska kontroller och / eller värden från medicinsk litteratur för diagnoser gjorda efter en "standard diagnostisk odyssey". För det sjätte spädbarnet, som fick en sekvensdiagnos vid ett andra sjukhusintag för återkommande symptom, uppskattade forskarna de pengar som skulle ha sparats om ingen andra inträde hade krävts.

      
     

När helgenomkodning användes i stället för standardtest var minskningen av sjukhusuppehållet mellan 2 och 42 dagar (6% till 69%).

      
     

I det mest extrema exemplet diagnostiserades ett barn med kolestas och medfödd hjärtsjukdom med Alagilles syndrom 3 dagar efter sekvensering. Syndromet orsakas av en mutation av JAG1 som försämrar Notch-signalering, vilket resulterar i avvikelser i gallkanalen och kardiopulmonell dysfunktion. Barnet hade planerats för ett kolangiogram och Kasai portoenterostomi för att rekonstruera de extrahepatiska gallkanalerna.

     

       Med en diagnos av Alagilles syndrom är Kasai-förfarandet inte angivet, så vi kunde stoppa detta ingrepp från att inträffa.
     

      
     

"Med en diagnos av Alagilles syndrom är Kasai-förfarandet inte indikerat, så vi kunde stoppa detta ingripande från att inträffa," sa Dr Chowdhury. Han noterade att rapporter i litteraturen tyder på att risken för morbiditet och mortalitet i samband med Kasai-förfarandet är markant högre för barn med Alagilles syndrom än för de utan och att levertransplantationsgraden är högre.

      
     

Bara i detta fall sparades en uppskattad $ 860.903.

      
     

I ett annat fall diagnostiserades ett 1 veckors barnuppfödningsbeslag med abnormiteter i genen KCNQ2 som kodar för kaliumkanaler. Mutationer i KCNQ2 är kända för att orsaka Ohtahara syndrom, en svårbar form av barndomsepilepsi. NICU-teamet lade karbamazepin – inte en vanlig förstalinjebehandling – till barnets behandlingsregim och reducerade doser av andra antiepileptika. Barnet släpptes ut på 18 dagar.

      
     

Ett år tidigare hade samma NICU-team tagit hand om ett barn med misstänkt Ohtahara-syndrom men hade inte fördelen av helgenomkodning. Det tog 6 veckor för molekylär testning för att bekräfta Ohtahara syndrom, under vilket barnet – som tillbringade 59 dagar på sjukhuset – upplevde ihållande anfall.

      
     

Barnet som behandlas först "är allvarligt utvecklingsskadligt", medan barnet som genomgick sekvensering "är vid denna tid utvecklingsmässigt normal", säger Dr Chowdhury.

     

       Snabb helgenomkodning uppskattades minska längden på vistelsen med 31% och inpatientkostnaden med 1,8 miljoner dollar.
     

      
     

I dessa sex spädbarn beräknades "snabb helgenomkodning minska vistelsens längd med 31% och inpatientkostnaden med 1,8 miljoner dollar", rapporterade han. Det motsvarar mer än 700 000 dollar för att sekvensera alla 42 barn.

      
     

Forskarna planerar att expandera sin studie så att de kan utvärdera tillvägagångssättet i olika populationer och hälsosystem och nyligen lanserat partnerskap med barnsjukhus i Kalifornien och Minnesota.

      
     

Övertyga försäkringsbolagen

     

"Vi som genetiker är övertygade om att sekvensering är helt fantastisk, och även läkare som skickar sina patienter till oss är övertygade om att det är en bra sak och en kostnadsbesparande intervention", säger Christian Gilissen, PhD, associerad professor i genom bioinformatik vid Radboud University i Nijmegen, Nederländerna.

      
     

Men "vi har mycket svårigheter att förklara detta för sjukförsäkringsbolag för ersättning", berättade han Medscape Medical News . Denna studie kan ändra det.

      
     

Forskarna "försökte vara väldigt rigorösa i hur de beräknade sina kostnader, ta fall och visa två banor och visa verkligen att det faktiskt är billigare", förklarade han .

      
     

"Jag tror att detta är ett av de bästa användningsfallen för genomet just nu hos nyfödda som är kritiskt sjuka", säger Gail Jarvik, MD, chef för divisionen av medicinsk genetik vid University of Washington i Seattle.

      
     

"Ju snabbare du kan komma till en diagnos, desto bättre kan du effektivt behandla", berättade hon Medscape Medical News . Och "du kan minska många testkostnader."

      
     

"Tyvärr har några av dessa barn störningar som inte kan behandlas. Men i det fallet kan du fatta beslutet att sluta behandla dem," tillade hon.

      
     

Denna studie finansierades med bidrag från Rady Family Foundation och andra filantropier och National Institute of Health. Dr Chowdhury, Dr Gilissen och Dr Jarvik har inte avslöjat några relevanta ekonomiska relationer.

      
     

American Society of Human Genetics (ASHG) 2017 årsmöte: Abstract 215. Presenterad 19 oktober 2017.

      
     

Följ Medscape på Twitter @Medscape och Neil Osterweil @NeilOsterweil

      
    

[ad_2]